郑怀杰的父亲郑作新是中国科学院院士，在解放前，他先后两次在国家危难时回国从事科研工作，以实现科学救国的梦想，成为我国现代鸟类学的奠基人。母亲陈嘉坚是全国妇联退休干部，服务社区多年，今年已103岁。在父母爱党爱国信念浸染下，四个子女三个是中共党员、一个是致公党成员，均事业有成，都是局、处级干部或教授、研究员。郑怀杰与杨群荣夫妇有三个儿子、两个孙女，一家七人是党员、两个是团员。